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畜牧兽医系与新希望六和股份有限公司、四川德康农牧食品集团股份有限公司、内蒙古正大食品有限公司、河北康宏牧业有限公司、黑龙江林甸优然牧业有限责任公司、黑龙江康贝牧业有限公司、杜尔伯特蒙古族自治县中都畜牧有限责任公司等国内规模化牧场；北京明安星动物医院、呼和浩特宠康动物医院、内蒙古宋大夫动物医院等20多家知名动物医院建立了长期稳定的校企合作关系。

2016年至今，以内蒙古正大集团、北京明安星动物医院为代表的企业为我系先后捐助价值4000元专业书籍；捐助小动物标本 15件；为我系参加校运会捐助1万元人民币。采取“场中校，校中场”模式的合作育人方式，通过企业教师进校园、实习学生进入企业跟岗实习和顶岗实习学生合作教学。同时利用寒暑假选派专业教师尤其年轻教师到企业参加实践。自2015年以来，利用寒暑期参加企业实践老师共40多人次。通过实践，专业教师们才能真正将理论与实践结合，将实践成果有效转化。