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畜牧兽医系高职专科开设畜牧兽医、动物医学（宠物医学方向）、宠物临床诊疗技术3个专业，中职开设畜牧兽医、宠物养护与经营2个专业，其中畜牧兽医专业为自治区精品专业，各专业均用蒙汉两种语言授课。立足全区、面向全国大中型畜禽养殖企业、动物医院，培养从事畜牧业、动物临床诊疗、宠物养护与经营领域生产、管理、服务的技术技能型人才。

实施理实一体化教学，践行“校中场，场中校”和“做中学，学中做”的职业教育理念，与国内各大型养殖企业及永星动物医院联盟开展合作育人。入学第三年，根据学生的专业爱好和就业愿望，在养殖场或动物医院进行专业课教学，实现专业教学与岗位技能训练的无缝对接。